Y tampoco fue similar la importancia que se dio a la innovación en las distintas regiones españolas durante el período que analiza el informe. En ese sentido, las comunidades autónomas que realizaron un mayor gasto en actividades para la innovación tecnológica en el año 2008 fueron la Comunidad de Madrid (realizó ella sola el 38,5% de todo el gasto en innovación tecnológica del país, al sumar 7.665,64 millones de euros), Cataluña (19,0%, es decir, 3.780,64 millones de euros) y País Vasco (9%, lo que supuso 1.791,1 millones), si bien, al margen de Ceuta y Melilla, Extremadura (+48,11%), Comunidad de Madrid (+32,81%), Aragón (+17,88), Navarra (+16,81%) y Asturias (16,26%) fueron las comunidades autónomas que presentaron mayores tasas de crecimiento en el gasto en innovación tecnológica con relación a ejercicios anteriores. Por el contrario, Canarias (-25,91%), Andalucía (-23,97%), Murcia (-20,01%), Baleares -7%), Cataluña (-3,73%) y La Rioja (-1,41%) fueron las que vieron descender su tasa de crecimiento en estos gastos.

No obstante, porcentualmente, La Rioja encabeza el mayor número de empresas innovadoras tecnológicamente, pues el 29,41% de todas las riojanas lo son, seguida por Navarra, donde son innovadoras tecnológicamente el 27,95% de sus compañías, País Vasco (27,11%), Aragón (25,22%), Cataluña (23,69%) y Castilla y León (20,65%). Por el contrario, al margen de Ceuta y Melilla, donde menos porcentaje de empresas innovadoras se encuentran es en Extremadura (solo el 14,17%), Baleares (14,36%) y Canarias (15,31%).

Con todo ello, las empresas buscaron como objetivo prioritario incrementar la calidad de los bienes y servicios (opinión del 40,4% de las empresas) o aumentar la capacidad de producción y prestación de servicios, opción que movió a un 35,1% de las compañías consultadas.